Молекулярный докинг орфанных рецепторов с амидами жирных кислот
https://doi.org/10.29235/1814-6023-2024-21-2-149-155
Аннотация
Одним из перспективных направлений разработки новых фармакологических препаратов для ослабления боли и других последствий повреждения периферических нервов считается изучение физиологических эффектов потенциальных агонистов рецепторов, связанных с G-белком, – амидов жирных кислот. С помощью методов молекулярного докинга и квантовой химии проведена оценка потенциальной селективности антагонистов рецепторов, связанных с G-белком, а также построены их комплексы с амидами жирных кислот. В результате докинга установлено, что для GPR18-рецепторов селективным антагонистом является PSB-CB5, а для GPR55 – O-1918. Показано, что между амидами жирных кислот (РЕА, SEА) и орфанными рецепторами GPR18 и GPR55 образуются стабильные комплексы, в которых при взаимодействии этих соединений с рецепторами ключевую роль играют многочисленные ван-дер-ваальсовые контакты и водородные связи.
Ключевые слова
Об авторах
А. С. Доронькина
Институт физиологии НАН Беларуси
Беларусь
Беларусь
Доронькина Анастасия Сергеевна – науч. сотрудник
ул. Академическая, 28, 220072, г. Минск
А. А. Рудак
Институт физиологии НАН Беларуси
Беларусь
Беларусь
Рудак Ангелина Александровна – мл. науч. сотрудник
ул. Академическая, 28, 220072, г. Минск
И. П. Жаворонок
Институт физиологии НАН Беларуси
Беларусь
Беларусь
Жаворонок Ирина Петровна – канд. биол. наук, заведующий центра изучения боли
ул. Академическая, 28, 220072, г. Минск
В. Г. Богдан
Отделение медицинских наук НАН Беларуси
Беларусь
Беларусь
Богдан Василий Генрихович – д-р мед. наук, профессор, академик-секретарь
пр-т Независимости, 66, 220072, г. Минск
Список литературы
1. Neuropathic pain / L. Colloca [et al.] // Nat. Rev. Dis. Primers. – 2017. – Vol. 3. – Art. 17002. https://doi.org/10.1038/nrdp.2017.2
2. The endogenous fatty acid amide, palmitoylethanolamide, has antiallodynic and anti-hyperalgesic effects in a murine model of neuropathic pain: involvement of CB (1), TRPV1 and PPARs receptors and neurotrophic factors / B. Costa [et al.] // Pain. – 2008. – Vol. 139, N 3. ‒ P. 541–550. https://doi.org/10.1016/j.pain.2008.06.003
3. Nourbakhsh, F. The role of orphan G protein-coupled receptors in the modulation of pain: A review / F. Nourbakhsh, R. Atabaki, A. Roohbakhsh // Life Sci. – 2018. – Vol. 212. – P. 59–69. https://doi.org/10.1016/j.lfs.2018.09.028
4. Investigation of adsorption tyrphostin AG528 anticancer drug upon the CNT (6, 6-6) nanotube: a DFT study / M. Sheikhi [et al.] // Curr. Mol. Med. – 2019. – Vol. 19, N 2. – P. 91–104. https://doi.org/10.2174/1566524019666190226111823
5. The orphan receptor GPR55 is a novel cannabinoid receptor / E. Ryberg [et al.] // Br. J. Pharm. – 2007. – Vol. 152, N 7. – P. 1092‒1101. https://doi.org/10.1038/sj.bjp.0707460
6. Gacasan, S. B. G protein-coupled receptors: The evolution of structural insight / S. B. Gacasan, D. L. Baker, A. L. Parrill // AIMS Biophys. – 2017. – Vol. 4, N 3. – P. 491–527. https://doi.org/10.3934/biophy.2017.3.491
7. Computational investigations on the binding mode of ligands for the cannabinoid-activated G protein-coupled receptor GPR18 / A. Neumann [et al.] // Biomolecules. – 2020. – Vol. 10, N 5. – Art. 686. https://doi.org/10.3390/biom10050686
8. Neuropathic pain in the general population: A systematic review of epidemiological studies / O. van Hecke [et al.] // Pain. – 2014. – Vol. 155, N 4. – P. 654–662. https://doi.org/10.1016/j.pain.2013.11.013
9. Ezzili, C. Fatty acid amide signaling molecules / C. Ezzili, K. Otrubova, D. L. Boger // Bioorg. Med. Chem. Lett. – 2010. – Vol. 20, N 20. – Р. 5959–5968. https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2010.08.048
10. Shahab, S. Antioxidant properties of the phorbol: A DFT approach / S. Shahab, M. Sheikhi // Russ. J. Phys. Chem. – 2020. – Vol. 14. – P. 15–18. https://doi.org/10.1134/S199079312001045
11. Molecular investigations of the newly synthesized azomethines as antioxidants: theoretical and experimental studies / S. Shahab [et al.] // Curr. Mol. Med. – 2019. – Vol. 19, N 6. – P. 419–433. https://doi.org/10.2174/1566524019666190509102620
12. Computational investigations on the binding mode of ligands for the cannabinoid-activated G protein-coupled receptor GPR18 / A. Neumann [et al.] // Biomolecules. – 2020. – Vol. 10, N 5. – P. 686–694. https://doi.org/10.3390/biom10050686
13. The orphan receptor GPR55 is a novel cannabinoid receptor / E. Ryberg [et al.] // Br. J. Pharmacol. – 2009. – Vol. 157, N 7. – P. 1092–1101. https://doi.org/10.1038/sj.bjp.0707460
14. Molecular and functional interaction between GPR18 and cannabinoid CB2 G-protein-coupled receptors. Relevance in neurodegenerative diseases / I. Reyes-Resina [et al.] // Biochem. Pharmacol. – 2018. – N 157. – Р. 169–179. https://doi.org/10.1016/j.bcp.2018.06.001
15. Alexander, S. P. G protein-coupled receptors / S. P. Alexander, A. Christopoulos, A. P. Davenport // Br. J. Pharmacol. – 2017. – N 175. – P. 117–129.
Рецензия
Для цитирования:
Доронькина А.С., Рудак А.А., Жаворонок И.П., Богдан В.Г. Молекулярный докинг орфанных рецепторов с амидами жирных кислот. Известия Национальной академии наук Беларуси. Серия медицинских наук. 2024;21(2):149-155. https://doi.org/10.29235/1814-6023-2024-21-2-149-155
For citation:
Doronkina А.S., Rudak А.А., Zhavoronok I.Р., Bogdan V.G. Molecular docking of orphan receptors with fatty acid amide. Proceedings of the National Academy of Sciences of Belarus, Medical series. 2024;21(2):149-155. (In Russ.) https://doi.org/10.29235/1814-6023-2024-21-2-149-155
Просмотров: 127
Послать статью по эл. почте 