Виртуальный скрининг биологической активности амидов жирных кислот
https://doi.org/10.29235/1814-6023-2024-21-1-16-25
Анатацыя
Проведено 3D-моделирование с целью изучения биодоступности амидов жирных кислот. Методом молекулярного докинга построены их комплексы с рецептором PPARα. Показано, что амиды жирных кислот, исходя из «правила пяти» Липинского, в связи с низкой растворимостью в воде, высокой липофильностью и конформационной гибкостью обладают слабой биодоступностью, что ограничивает их усвояемость при пероральном приеме. В результате докинга амидов жирных кислот с рецептором PPARα выявлено образование стабильных комплексов, которые характеризуются наличием водородных связей и сетью ван-дер-ваальсовых контактов.
Аб аўтарах
А. Доронькина
Институт физиологии НАН Беларуси
Беларусь
Беларусь
А. Рудак
Институт физиологии НАН Беларуси
Беларусь
Беларусь
И. Жаворонок
Институт физиологии НАН Беларуси
Беларусь
Беларусь
В. Богдан
Отделение медицинских наук НАН Беларуси
Беларусь
Беларусь
Спіс літаратуры
1. Chronic pain as a symptom or a disease: the IASP classification of chronic pain for the international classification of diseases(ICD-11)/R.-D. Treede [et al.]// Pain. – 2019. – Vol. 160, N 1. – P. 19–27. https://doi.org/10.1097/j.pain.0000000000001384
2. The IASP classification of chronic pain for ICD-11: chronic neuropathic pain / J. Scholz [et al.] // Pain. – 2019. – Vol. 160, N 1. – P. 53–59. https://doi.org/10.1097/j.pain.0000000000001365
3. Stratification of neuropathic pain patients: the road to mechanism-based therapy? / J. Forstenpointner [et al.] // Curr. Opin. Anaesthesiol. – 2018. – Vol. 31, N 5. – P. 562–568. https://doi.org/10.1097/ACO.0000000000000642
4. Ultramicronized palmitoylethanolamide in spinal cord injury neuropathic pain: a randomized, double-blind, placebocontolled trial / S.R. Andresen [et al.]// Pain. – 2016. – Vol. 157, N 9. – P. 2097–2103. https://doi.org/10.1097/j.pain.0000000000000623
5. Rates of opioid misuse, abuse, and addiction in chronic pain: a systematic review and data synthesis / K. E. Vowles [et al.] // Pain. – 2015. – Vol. 156, N 4. – P. 569–576. https://doi.org/10.1097/01.j.pain.0000460357.01998.f1
6. Neuropathic pain: an updated grading system for research and clinical practice / N. B. Finnerup [et al.] // Pain. – 2016. – Vol. 157, N 8. – P. 1599–1606. https://doi.org/10.1097/j.pain.0000000000000492
7. Rice, A. S. C. Pain and the global burden of disease / A. S. C. Rice, B. H. Smith, F. M. Blyth // Pain. – 2016. – Vol. 57, N 4. – P. 791–796. https://doi.org/10.1097/j.pain.0000000000000454
8. Ezzili, C. Fatty acid amide signaling molecules / C. Ezzili, K. Otrubova, D. L. Boger // Bioorg. Med. Chem. Lett. – 2010. – Vol. 20, N 20. – Р. 5959–5968. https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2010.08.048
9. Differential expression of peroxisome proliferator-activated receptors (PPARs): tissue distribution of PPAR-alpha, -beta, and -gamma in the adult rat / O. Braissant [et al.] // Endocrinology. – 1996. – Vol. 137, N 1. – P. 354–366. https://doi.org/10.1210/endo.137.1.8536636
10. Daina, A. SwissADME: A free web tool to evaluate pharmacokinetics, drug-likeness and medicinal chemistry friendliness of small molecules / A. Daina, O. Michielin, V. Zoete // Sci. Rep. – 2017. – Vol. 7. – Art. 42717. https://doi.org/10.1038/srep42717
11. Hastings, J. ChEBI in 2016: Improved services and an expanding collection of metabolites / J. Hastings, G. Owen, A. Dekker // Nucl. Acids Res. – 2016. – Vol. 44, N D1. – P. D1214–D1219. https://doi.org/10.1093/nar/gkv1031
12. Spectroscopic studies (geometry optimization, E → Z isomerization, UV/Vis, excited states, FT-IR, HOMO-LUMO, FMO, MEP, NBO, polarization) and anisotropy of thermal and electrical conductivity of new azomethine dyes in stretched polymer matrix / S. Shahab [et al.] // Silicon. – 2018. – Vol. 10. – P. 2361–2385. https://doi.org/10.1007/s12633-018-9773-8
13. Shahab, S. Antioxidant properties of the phorbol: A DFT approach / S. Shahab, M. Sheikhi // Russ. J. Chem. B. – 2020. – Vol. 14. – P. 15–18. https://doi.org/10.1134/S1990793120010145
14. Molecular investigations of the newly synthesized azomethines as antioxidants: theoretical and experimental studies / S. Shahab [et al.] // Curr. Mol. Med. – 2019. – Vol. 19, N 6. – P. 419–433. https://doi.org/10.2174/1566524019666190509102620
15. Investigation of adsorption tyrphostin AG528 anticancer drug upon the CNT (6, 6-6) nanotube: a DFT study / M. Sheikhi [et al.] // Curr. Mol. Med. – 2019. – Vol. 19, N 2. – P. 91–104. https://doi.org/10.2174/1566524019666190226111823
16. Investigation of the adsorption Rubraca anticancer drug on the CNT (4, 4-8) nanotube as a factor of drug delivery: a theoretical study based on DFT method / M. Sheikhi [et al.] // Curr. Mol. Med. – 2019. – Vol. 19, N 7. – P. 473–486. https://doi.org/10.2174/1566524019666190506143152
17. Effectiveness of the association micronized N-palmitoylethanolamine (PEA)-transpolydatin in the treatment of chronic pelvic pain related to endometriosis after laparoscopic assessment: a pilot study / L. Cobellis [et al.] // Eur. J. Obstet. Gynecol. Reprod. Biol. – 2011. – Vol. 158, N 1. – P. 82‒86. https://doi.org/10.1016/j.ejogrb.2011.04.011
##reviewer.review.form##
Для цытавання:
Доронькина А.С., Рудак А.А., Жаворонок И.П., Богдан В.Г. Виртуальный скрининг биологической активности амидов жирных кислот. Известия Национальной академии наук Беларуси. Серия медицинских наук. 2024;21(1):16-25. https://doi.org/10.29235/1814-6023-2024-21-1-16-25
For citation:
Doronkina A.S., Rudak A.A., Zhavoronok I.P., Bogdan V.G. Virtual screening of the biological activity of fatty acid amides. Proceedings of the National Academy of Sciences of Belarus, Medical series. 2024;21(1):16-25. (In Russ.) https://doi.org/10.29235/1814-6023-2024-21-1-16-25
Праглядаў:
295
Паслаць артыкул па эл. пошце 