Доступ открыт Открытый доступ  Доступ закрыт Только для подписчиков

Генетические варианты парвовируса B19, циркулирующие в Беларуси в течение эпидемического цикла инфекции (2005–2016)


https://doi.org/10.29235/1814-6023-2019-16-1-35-45

Полный текст:


Аннотация

Парвовирусная инфекция человека характеризуется разнообразием клинических проявлений. На основании генетического анализа у парвовируса В19 выделяют генотипы 1a, 1b, 2, 3a, 3b, которые имеют различное территориальное распространение. В период 2005–2016 гг. в Беларуси было генотипировано 210 парвовирусов В19, полученных из сыворотки крови пациентов с разными формами парвовирусной инфекции, преимущественно инфекционной эритемы. Все вирусы, за исключением одного, принадлежали к генотипу 1а. Один вирус относился к генотипу 3b и был выделен от ребенка с апластическим кризом, прибывшего в Беларусь из Казахстана на лечение. Штаммы генотипа 1а на филогенетическом древе формировали две группы, относящиеся к субтипам 1а1 и 1а2. В течение 12 лет наблюдения на территории страны циркулировали оба субтипа, однако с разной интенсивностью. В годы наиболее высокой заболеваемости, а также один-два года до и после эпидемического подъема (2005–2008 и 2013–2016) в циркуляции преобладали парвовирусы субтипа 1а2. В период низкой заболеваемости (2009–2012) доминирующее положение занимал субтип 1а1. Среднее генетическое расстояние внутри субтипа составляло 0,51 % для 1а1 и 0,56 % для 1а2, между субтипами оно также было небольшим – 1,32 %. Можно предположить, что субтип 1а2 является более новым для Беларуси, вследствие чего имеет большее эпидемическое значение в настоящее время.


Об авторах

М. А. Ермолович
Республиканский научно-практический центр эпидемиологии и микробиологии
Беларусь

Ермолович Марина Анатольевна – кандидат медицинских наук, ведущий научный сотрудник

ул. Филимонова, 23, 220114, г. Минск



Г. В. Семейко
Республиканский научно-практический центр эпидемиологии и микробиологии
Беларусь

Семейко Галина Валерьевна – кандидат биологических наук, ведущий научный сотрудник

ул. Филимонова, 23, 220114, г. Минск



Е. О. Самойлович
Республиканский научно-практический центр эпидемиологии и микробиологии
Беларусь

Самойлович Елена Олеговна – доктор медицинских наук, профессор, заведующий лабораторией

ул. Филимонова, 23, 220114, г. Минск



Список литературы

1. Qiu, J. Human parvoviruses / J. Qiu, M. Söderlund-Venermo, N. S. Young // Clin. Microbiol. Rev. – 2017. – Vol. 30, N 1. – P. 43–113.

2. Genetic diversity within human erythroviruses: identifcation of three genotypes / A. Servant [et al.] // J. Virol. – 2002. – Vol. 76, N 18. – P. 9124–9134. https://doi.org/10.1128/jvi.76.18.9124-9134.2002

3. Phylogenetic analysis of human parvovirus B19, indicating two subgroups of genotype 1 in Vietnamese patients / N. Toan [et al.] // J. Gen. Virol. – 2006. – Vol. 87, N 10. – P. 2941–2949. https://doi.org/10.1099/vir.0.82037-0

4. Identifcation and genetic diversity of two human parvovirus B19 genotype 3 subtypes / A. Parsyan [et al.] // J. Gen. Virol. – 2007. – Vol. 88, pt. 2. – P. 428–431. https://doi.org/10.1099/vir.0.82496-0

5. Identifcation and characterization of persistent human erythrovirus infection in blood donor samples / D. Candotti [et al.] // J. Virol. – 2004. – Vol. 78, N 22. – P. 12169–12178. https://doi.org/10.1128/jvi.78.22.12169-12178.2004

6. Cohen, B. Genetic variants of parvovirus B19 identifed in the United Kingdom: implications for diagnostic testing / B. Cohen, J. Gandhi, J. Clewley // Clin. Virol. – 2006. – Vol. 36, N 2. – P. 152–155. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2006.01.011

7. Detection and differentiation of human parvovirus variants by commercial quantitative real-time PCR tests / K. Hokynar [et al.] // J. Clin. Microbiol. – 2004. – Vol. 42, N 5. – P. 2013–2019. https://doi.org/10.1128/jcm.42.5.2013-2019.2004

8. Phylogenetic analysis of human parvovirus b19 sequences from eleven different countries confrms the predominance of genotype 1 and suggests the spread of genotype 3b / J. Hubschen [et al.] // J. Clin. Microbiol. – 2009. – Vol. 47, N 11. – P. 3735–3738. https://doi.org/10.1128/jcm.01201-09

9. Sequence variability of human erythroviruses present in bone marrow of Brazilian patients with various parvovirus B19-related hematological symptoms / S. Sanabani [et al.] // J. Clin. Microbiol. – 2006. – Vol. 44, N 2. – P. 604–606. https://doi.org/10.1128/jcm.44.2.604-606.2006

10. Nicolay, N. Clinical and epidemiological aspects of parvovirus B19 infections in Ireland, January 1996–June 2008 / N. Nicolay, S. Cotter // Eurosurveillance. – 2009. – Vol. 14, N 25. – P. 7–11.

11. Genetic variants of human parvovirus B19 in South Africa: cocirculation of three genotypes and identifcation of a novel subtype of genotype 1 / C. Corcoran [et al.] // J. Clin. Microbiol. – 2010. – Vol. 48, N 1. – P. 137–142. https://doi.org/10.1128/jcm.00610-09

12. Identifcation and characterization of acute infection with parvovirus B19 genotype 2 in immunocompromised patients in Poland / P. Grabarczyk [et al.] // J. Med .Virol. – 2010. – Vol. 83, N 1. – P. 142–149. https://doi.org/10.1002/jmv.21947

13. Генотипирование изолятов парвовируса В19, циркулирующих в Северо-Западном федеральном округе России / И. Н. Лаврентьева [и др.] // Журн. микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. – 2013. – № 6. – C. 36–43.

14. Investigation of human parvovirus B19 occurrence and genetic variability in different leukaemia entities / A. C. da Costa [et al.] // Clin. Microbiol. Infect. – 2013. – Vol. 19, N 1. – P. E31–E43. https://doi.org/10.1111/1469-0691.12058

15. Prevalence and genotypic characterization of human parvovirus B19 in children with measles- and rubella-like illness in Iran / F. Rezaei [et al.] // J. Med. Virol. – 2015. – Vol. 88, N 6. – P. 947–953. https://doi.org/10.1002/jmv.24425

16. Genotype 1 of human parvovirus B19 in clinical cases / M. I. de Oliveira [et al.] // Rev. Assoc. Med. Bras. – 2017. – Vol. 63, N 3. – P. 224–228. https://doi.org/10.1590/1806-9282.63.03.224

17. Young, N. Parvovirus B19 / N. S. Young, K. E. Brown // N. Engl. J. Med. – 2004. – Vol. 350, N 6. – P. 586–597. https://doi.org/10.1056/nejmra030840

18. Динамика эпидемического процесса парвовирусной инфекции в Республике Беларусь (2005–2016) / М. А. Ермолович [и др.] // Журн. Гродн. гос. мед. ун-та. – 2017. – Т. 15, № 4. – C. 414–417.

19. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods / K. Tamura [et al.] // Mol. Biol. Evol. – 2011. – Vol. 28, N 10. – P. 2731–2739. https://doi.org/10.1093/molbev/msr121

20. Human parvovirus B19 surveilance in patients with rash and fever from Belarus / M. Yermalovich [et al.] // J. Med. Virol. – 2012. – Vol. 84, N 6. – P. 973–978. https://doi.org/10.1002/jmv.23294

21. Umene, K. Genetic diversity of human parvovirus B19 determined using a set of restriction endonucleases recognizing four or fve base pairs and partial nucleotide sequencing: use of sequence variability in virus classifcation / K. Umene, T. Nunoue // J. Gen. Virol. – 1991. – Vol. 72, N 8. – P. 1997–2001. https://doi.org/10.1099/0022-1317-72-8-1997

22. Molecular characterization of human erythrovirus B19 strains obtained from patients with several clinical presentations in the Amazon region of Brazil / R. Freitas [et al.] // J. Clin. Virol. – 2008. – Vol. 43, N 1. – P. 60–65. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2008.03.033

23. Global co-existence of two evolutionary lineages of parvovirus B19 1a, different in genome-wide synonymous positions / M. W. A. Molenaar-de Backer [et al.] // PLoS ONE. – 2012. – Vol. 7, N 8. – P. e43206. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0043206

24. Molecular diversity of human parvovirus B19 during two outbreaks of erythema infectiosum in Brazil / R. Cubel Garcia [et al.] // Braz. J. Infect. Dis. – 2017. – Vol. 21, N 1. – P. 102–106. https://doi.org/10.1016/j.bjid.2016.11.002

25. Molecular and phylogenetic analyses of human Parvovirus B19 isolated from Brazilian patients with sickle cell disease and β-thalassemia major and healthy blood donors / S. Slavov [et al.] // J. Med. Virol. – 2012. – Vol. 84, N 10. – P. 1652–1665. https://doi.org/10.1002/jmv.23358


Дополнительные файлы

Для цитирования: Ермолович М.А., Семейко Г.В., Самойлович Е.О. Генетические варианты парвовируса B19, циркулирующие в Беларуси в течение эпидемического цикла инфекции (2005–2016). Известия Национальной академии наук Беларуси. Серия медицинских наук. 2019;16(1):35-45. https://doi.org/10.29235/1814-6023-2019-16-1-35-45

For citation: Yermalovich M.A., Semeiko G.V., Samoilovich E.O. Genetic variants of parvovirus B19 circulating in Belarus during the epidemic cycle of infection (2005–2016). Proceedings of the National Academy of Sciences of Belarus, Medical series. 2019;16(1):35-45. (In Russ.) https://doi.org/10.29235/1814-6023-2019-16-1-35-45

Просмотров: 102

Обратные ссылки

  • Обратные ссылки не определены.


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 1814-6023 (Print)
ISSN 2524-2350 (Online)