Молекулярный докинг орфанных рецепторов с амидами жирных кислот
https://doi.org/10.29235/1814-6023-2024-21-2-149-155
Анатацыя
Одним из перспективных направлений разработки новых фармакологических препаратов для ослабления боли и других последствий повреждения периферических нервов считается изучение физиологических эффектов потенциальных агонистов рецепторов, связанных с G-белком, – амидов жирных кислот. С помощью методов молекулярного докинга и квантовой химии проведена оценка потенциальной селективности антагонистов рецепторов, связанных с G-белком, а также построены их комплексы с амидами жирных кислот. В результате докинга установлено, что для GPR18-рецепторов селективным антагонистом является PSB-CB5, а для GPR55 – O-1918. Показано, что между амидами жирных кислот (РЕА, SEА) и орфанными рецепторами GPR18 и GPR55 образуются стабильные комплексы, в которых при взаимодействии этих соединений с рецепторами ключевую роль играют многочисленные ван-дер-ваальсовые контакты и водородные связи.
Аб аўтарах
А. Доронькина
Институт физиологии НАН Беларуси
Беларусь
Беларусь
А. Рудак
Институт физиологии НАН Беларуси
Беларусь
Беларусь
И. Жаворонок
Институт физиологии НАН Беларуси
Беларусь
Беларусь
В. Богдан
Отделение медицинских наук НАН Беларуси
Беларусь
Беларусь
Спіс літаратуры
1. Neuropathic pain / L. Colloca [et al.] // Nat. Rev. Dis. Primers. – 2017. – Vol. 3. – Art. 17002. https://doi.org/10.1038/nrdp.2017.2
2. The endogenous fatty acid amide, palmitoylethanolamide, has antiallodynic and anti-hyperalgesic effects in a murine model of neuropathic pain: involvement of CB (1), TRPV1 and PPARs receptors and neurotrophic factors / B. Costa [et al.] // Pain. – 2008. – Vol. 139, N 3. ‒ P. 541–550. https://doi.org/10.1016/j.pain.2008.06.003
3. Nourbakhsh, F. The role of orphan G protein-coupled receptors in the modulation of pain: A review / F. Nourbakhsh, R. Atabaki, A. Roohbakhsh // Life Sci. – 2018. – Vol. 212. – P. 59–69. https://doi.org/10.1016/j.lfs.2018.09.028
4. Investigation of adsorption tyrphostin AG528 anticancer drug upon the CNT (6, 6-6) nanotube: a DFT study / M. Sheikhi [et al.] // Curr. Mol. Med. – 2019. – Vol. 19, N 2. – P. 91–104. https://doi.org/10.2174/1566524019666190226111823
5. The orphan receptor GPR55 is a novel cannabinoid receptor / E. Ryberg [et al.] // Br. J. Pharm. – 2007. – Vol. 152, N 7. – P. 1092‒1101. https://doi.org/10.1038/sj.bjp.0707460
6. Gacasan, S. B. G protein-coupled receptors: The evolution of structural insight / S. B. Gacasan, D. L. Baker, A. L. Parrill // AIMS Biophys. – 2017. – Vol. 4, N 3. – P. 491–527. https://doi.org/10.3934/biophy.2017.3.491
7. Computational investigations on the binding mode of ligands for the cannabinoid-activated G protein-coupled receptor GPR18 / A. Neumann [et al.] // Biomolecules. – 2020. – Vol. 10, N 5. – Art. 686. https://doi.org/10.3390/biom10050686
8. Neuropathic pain in the general population: A systematic review of epidemiological studies / O. van Hecke [et al.] // Pain. – 2014. – Vol. 155, N 4. – P. 654–662. https://doi.org/10.1016/j.pain.2013.11.013
9. Ezzili, C. Fatty acid amide signaling molecules / C. Ezzili, K. Otrubova, D. L. Boger // Bioorg. Med. Chem. Lett. – 2010. – Vol. 20, N 20. – Р. 5959–5968. https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2010.08.048
10. Shahab, S. Antioxidant properties of the phorbol: A DFT approach / S. Shahab, M. Sheikhi // Russ. J. Phys. Chem. – 2020. – Vol. 14. – P. 15–18. https://doi.org/10.1134/S199079312001045
11. Molecular investigations of the newly synthesized azomethines as antioxidants: theoretical and experimental studies / S. Shahab [et al.] // Curr. Mol. Med. – 2019. – Vol. 19, N 6. – P. 419–433. https://doi.org/10.2174/1566524019666190509102620
12. Computational investigations on the binding mode of ligands for the cannabinoid-activated G protein-coupled receptor GPR18 / A. Neumann [et al.] // Biomolecules. – 2020. – Vol. 10, N 5. – P. 686–694. https://doi.org/10.3390/biom10050686
13. The orphan receptor GPR55 is a novel cannabinoid receptor / E. Ryberg [et al.] // Br. J. Pharmacol. – 2009. – Vol. 157, N 7. – P. 1092–1101. https://doi.org/10.1038/sj.bjp.0707460
14. Molecular and functional interaction between GPR18 and cannabinoid CB2 G-protein-coupled receptors. Relevance in neurodegenerative diseases / I. Reyes-Resina [et al.] // Biochem. Pharmacol. – 2018. – N 157. – Р. 169–179. https://doi.org/10.1016/j.bcp.2018.06.001
15. Alexander, S. P. G protein-coupled receptors / S. P. Alexander, A. Christopoulos, A. P. Davenport // Br. J. Pharmacol. – 2017. – N 175. – P. 117–129.
##reviewer.review.form##
Для цытавання:
Доронькина А.С., Рудак А.А., Жаворонок И.П., Богдан В.Г. Молекулярный докинг орфанных рецепторов с амидами жирных кислот. Известия Национальной академии наук Беларуси. Серия медицинских наук. 2024;21(2):149-155. https://doi.org/10.29235/1814-6023-2024-21-2-149-155
For citation:
Doronkina А.S., Rudak А.А., Zhavoronok I.Р., Bogdan V.G. Molecular docking of orphan receptors with fatty acid amide. Proceedings of the National Academy of Sciences of Belarus, Medical series. 2024;21(2):149-155. (In Russ.) https://doi.org/10.29235/1814-6023-2024-21-2-149-155
Праглядаў: 128
Паслаць артыкул па эл. пошце 